Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cwc22Q8C5N3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cwc22Q8C5N3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms