Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc90bQ8C3X2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc90bQ8C3X2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms