Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1B2

Tiparp, TCDD-inducible poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TiparpQ8C1B2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TiparpQ8C1B2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TiparpQ8C1B2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TiparpQ8C1B2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TiparpQ8C1B2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TiparpQ8C1B2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TiparpQ8C1B2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TiparpQ8C1B2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TiparpQ8C1B2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TiparpQ8C1B2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms