Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pm20d1Q8C165 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pm20d1Q8C165 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pm20d1Q8C165 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pm20d1Q8C165 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pm20d1Q8C165 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pm20d1Q8C165 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pm20d1Q8C165 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms