Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Actrt3Q8BXF8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Actrt3Q8BXF8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Actrt3Q8BXF8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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