Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX46

Skor1, SKI family transcriptional corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skor1Q8BX46 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Skor1Q8BX46 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Skor1Q8BX46 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Skor1Q8BX46 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms