Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ube3dQ8BX13 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ube3dQ8BX13 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ube3dQ8BX13 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ube3dQ8BX13 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ube3dQ8BX13 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms