Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rps6kb1Q8BSK8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6kb1Q8BSK8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6kb1Q8BSK8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6kb1Q8BSK8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6kb1Q8BSK8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6kb1Q8BSK8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6kb1Q8BSK8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6kb1Q8BSK8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rps6kb1Q8BSK8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6kb1Q8BSK8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms