Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjd4Q8BSD4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjd4Q8BSD4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms