Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
5730596B20RikQ8BQ08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
5730596B20RikQ8BQ08 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms