Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Efemp1Q8BPB5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Efemp1Q8BPB5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms