Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ckap4Q8BMK4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ckap4Q8BMK4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ckap4Q8BMK4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ckap4Q8BMK4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms