Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnrc6bQ8BKI2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnrc6bQ8BKI2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnrc6bQ8BKI2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnrc6bQ8BKI2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms