Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d3Q8BJ83 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d3Q8BJ83 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms