Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prune1Q8BIW1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prune1Q8BIW1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms