Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gabra5Q8BHJ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gabra5Q8BHJ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabra5Q8BHJ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms