Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf41Q8BH75 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf41Q8BH75 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms