Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX3

Lrtm2, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm2Q8BGX3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lrtm2Q8BGX3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrtm2Q8BGX3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms