Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrtm2Q8BGA3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrtm2Q8BGA3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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