Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Tnpo1Q8BFY9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnpo1Q8BFY9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo1Q8BFY9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms