Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smim19Q80ZU4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Smim19Q80ZU4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms