Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbbp8Q80YR6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbbp8Q80YR6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms