Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc28Q80XJ3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc28Q80XJ3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc28Q80XJ3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc28Q80XJ3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc28Q80XJ3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc28Q80XJ3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc28Q80XJ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ttc28Q80XJ3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms