Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl29Q80T74 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl29Q80T74 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms