Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dsg1bQ7TSF1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Dsg1bQ7TSF1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg1bQ7TSF1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms