Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ckap2lQ7TS74 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms