Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Tnfsf18Q7TS55 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tnfsf18Q7TS55 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms