Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Actn1Q7TPR4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Actn1Q7TPR4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Actn1Q7TPR4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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