Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prrc2bQ7TPM1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prrc2bQ7TPM1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms