Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mycbp2Q7TPH6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mycbp2Q7TPH6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms