Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sbno2Q7TNB8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sbno2Q7TNB8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms