Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r3cQ7TMB3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r3cQ7TMB3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r3cQ7TMB3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ppp1r3cQ7TMB3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp1r3cQ7TMB3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms