Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cd3eapQ76KJ5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cd3eapQ76KJ5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms