Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rph3alQ768S4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms