Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Trpv1Q704Y3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trpv1Q704Y3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trpv1Q704Y3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms