Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2d2bQ6ZWY6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2d2bQ6ZWY6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms