Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ncapd3Q6ZQK0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Ncapd3Q6ZQK0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncapd3Q6ZQK0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncapd3Q6ZQK0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms