Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Topbp1Q6ZQF0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Topbp1Q6ZQF0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Topbp1Q6ZQF0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms