Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd300ld3Q6SJQ5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd300ld3Q6SJQ5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd300ld3Q6SJQ5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd300ld3Q6SJQ5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd300ld3Q6SJQ5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cd300ld3Q6SJQ5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms