Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gja6Q6S5G4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gja6Q6S5G4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms