Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt9Q6RHW0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Krt9Q6RHW0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms