Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp2b4Q6Q477 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp2b4Q6Q477 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms