Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc57Q6PHN1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc57Q6PHN1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms