Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc35e3Q6PGC7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc35e3Q6PGC7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms