Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc82Q6PG04 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc82Q6PG04 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms