Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Taf1cQ6PDZ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Taf1cQ6PDZ2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms