Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dtx4Q6PDK8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dtx4Q6PDK8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms