Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcc2Q6PDG5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcc2Q6PDG5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms