Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAI4

Lce3f, Late cornified envelope 3F, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3fQ6PAI4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Lce3fQ6PAI4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms