Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Fam222bQ6P539 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fam222bQ6P539 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms